Amazon Workspaces とはAmazon が提供している仮想デスクトップサービスで windows などの OS に加えていくつかのアプリが構築された環境が使えるようなサービスといった感じです。
今まで Mac だと EC2 で windows 環境のインスタンスを立ててたので新しい方法としていいかもしれないです。
EC2 で windows 環境のインスタンスを立ち上げるのと Amazon Workspaces で windows 環境を構築する違いは以下の URL が参考になるかもしれないです。
http://dev.classmethod.jp/cloud/aws/ec2-vs-workspaces-2/
恐らく一日中起動させっぱなしのサーバーなどを想定する場合は Amazon Workspaces の方がいいかもしれないです。
