hacknote.jpでも出ていた現象。どうやらプラグイン内部の方に問題があったようです。
下記の通り直して今は問題なくなっていますー。

search everythingのハイライト時の文字化け対策
http://web-clutch.com/search-everything-mojibake/

行数は変わっていたので、

$postcontent = preg_replace(

でプラグイン内部を検索し、該当部分を修正しました。